अमीनो एसिड एक प्रकार का कार्बनिक अम्ल है जिसमें एक कार्बोक्सिल समूह (COOH) और एक अमीनो समूह (NH) दोनों होते हैं2). अमीनो एसिड के लिए सामान्य सूत्र नीचे दिया गया है। यद्यपि न्यूट्रली-चार्ज संरचना आमतौर पर लिखी जाती है, यह गलत है क्योंकि अम्लीय COOH और मूल NH2 समूह एक दूसरे के साथ प्रतिक्रिया करते हैं जो एक आंतरिक नमक बनता है जिसे ज़्विटरेशन कहा जाता है। Zwitterion का कोई शुद्ध शुल्क नहीं है; एक नकारात्मक (COO) है-) और एक सकारात्मक (एनएच)3+) चार्ज।
इसमें 20 अमीनो एसिड होते हैं प्रोटीन. जबकि उन्हें वर्गीकृत करने के कई तरीके हैं, सबसे आम में से एक है उन्हें अपनी साइड चेन की प्रकृति के अनुसार समूहित करना।
आठ हैं अमीनो अम्ल नॉनपोलर साइड चेन के साथ। ग्लाइसिन, ऐलेनिन, और प्रोलिन में छोटी, बिना छेद वाली साइड चेन होती हैं और ये सभी कमजोर हाइड्रोफोबिक होती हैं। फेनिलएलनिन, वेलिन, ल्यूसीन, आइसोलेकिन, और मेथियोनीन में बड़ी साइड चेन होती हैं और अधिक दृढ़ता से हाइड्रोफोबिक होती हैं।
ध्रुवीय, अपरिवर्तित पक्ष श्रृंखलाओं के साथ आठ अमीनो एसिड भी होते हैं। सेरीन और थ्रेओनीन में हाइड्रॉक्सिल समूह होते हैं। शतावरी और ग्लूटामाइन के बीच समूह होते हैं। हिस्टिडीन और ट्रिप्टोफैन में हेटरोसाइक्लिक एरोमैटिक अमीन साइड चेन हैं। सिस्टीन में एक सल्फहाइड्रील समूह होता है। टायरोसिन में एक फेनोलिक पक्ष श्रृंखला होती है। सिस्टीन के सल्फोहाइड्रील समूह, टायरोसिन के फेनोलिक हाइड्रॉक्सिल समूह, और हिस्टिडीन के इमिडाज़ोल समूह सभी पीएच-निर्भर आयनीकरण की कुछ डिग्री दिखाते हैं।
आरोपित साइड चेन के साथ चार अमीनो एसिड होते हैं। एस्पार्टिक एसिड और ग्लूटामिक एसिड में उनके साइड चेन पर कार्बोक्सिल समूह होते हैं। प्रत्येक एसिड पीएच 7.4 पर पूरी तरह से आयनित होता है। Arginine और lysine में एमिनो समूहों के साथ साइड चेन हैं। उनकी साइड चेन पीएच 7.4 पर पूरी तरह से प्रोटॉन हैं।